est l’étude de petites molécules, communément appelées métabolites, dans les cellules, les biofluides, les tissus ou les organismes. L’analyse des métabolites est dynamique et facteur dépendante (environnement, stress, alimentation…), elle permet donc de produire un profil métabolique au plus proche du phénotype (empreinte des perturbations biochimiques).